Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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TRAF2Q12933 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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