Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms