Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms