Protein–RNA interactions for Protein: Q07326

PIGF, Phosphatidylinositol-glycan biosynthesis class F protein, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGFQ07326 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PIGFQ07326 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PIGFQ07326 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PIGFQ07326 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PIGFQ07326 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PIGFQ07326 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PIGFQ07326 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PIGFQ07326 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PIGFQ07326 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PIGFQ07326 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PIGFQ07326 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PIGFQ07326 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PIGFQ07326 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PIGFQ07326 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PIGFQ07326 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PIGFQ07326 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PIGFQ07326 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PIGFQ07326 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PIGFQ07326 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PIGFQ07326 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PIGFQ07326 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PIGFQ07326 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
PIGFQ07326 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PIGFQ07326 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PIGFQ07326 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PIGFQ07326 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms