Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms