Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 ZNRD1-204ENST00000376785 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 RDM1-216ENST00000613308 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC6Q03468 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 AC006547.1-209ENST00000596334 996 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 AC007728.1-202ENST00000564510 787 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 OR2T27-201ENST00000344889 954 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 HNRNPABP1-201ENST00000406003 734 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 AC022121.1-201ENST00000484584 579 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 CCNL2P1-201ENST00000512846 969 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms