Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms