Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms