Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPL23P62829 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPL23P62829 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
RPL23P62829 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
RPL23P62829 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
RPL23P62829 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
RPL23P62829 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
RPL23P62829 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
RPL23P62829 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
RPL23P62829 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
RPL23P62829 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
RPL23P62829 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
RPL23P62829 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
RPL23P62829 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
RPL23P62829 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms