Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms