Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAD23AP54725 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms