Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms