Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGGT1BP53609 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PGGT1BP53609 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PGGT1BP53609 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PGGT1BP53609 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PGGT1BP53609 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PGGT1BP53609 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PGGT1BP53609 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PGGT1BP53609 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PGGT1BP53609 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PGGT1BP53609 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PGGT1BP53609 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PGGT1BP53609 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PGGT1BP53609 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PGGT1BP53609 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PGGT1BP53609 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PGGT1BP53609 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PGGT1BP53609 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PGGT1BP53609 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PGGT1BP53609 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PGGT1BP53609 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PGGT1BP53609 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PGGT1BP53609 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PGGT1BP53609 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 232.8 ms