Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRCA2P51587 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRCA2P51587 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRCA2P51587 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRCA2P51587 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms