Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FNTAP49354 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FNTAP49354 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FNTAP49354 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FNTAP49354 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FNTAP49354 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FNTAP49354 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FNTAP49354 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FNTAP49354 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTAP49354 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTAP49354 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTAP49354 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTAP49354 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTAP49354 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTAP49354 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTAP49354 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTAP49354 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTAP49354 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTAP49354 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTAP49354 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTAP49354 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTAP49354 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTAP49354 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTAP49354 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTAP49354 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTAP49354 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTAP49354 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTAP49354 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTAP49354 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTAP49354 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTAP49354 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTAP49354 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTAP49354 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTAP49354 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTAP49354 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTAP49354 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTAP49354 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTAP49354 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTAP49354 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTAP49354 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTAP49354 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTAP49354 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTAP49354 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTAP49354 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTAP49354 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTAP49354 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTAP49354 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTAP49354 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTAP49354 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTAP49354 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTAP49354 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTAP49354 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTAP49354 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms