Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC11A1P49279 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms