Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC1A1P43005 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC1A1P43005 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC1A1P43005 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC1A1P43005 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC1A1P43005 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC1A1P43005 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC1A1P43005 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A1P43005 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A1P43005 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A1P43005 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A1P43005 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A1P43005 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A1P43005 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A1P43005 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A1P43005 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A1P43005 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A1P43005 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A1P43005 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A1P43005 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A1P43005 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A1P43005 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A1P43005 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A1P43005 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms