Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBP1P32455 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBP1P32455 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBP1P32455 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBP1P32455 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBP1P32455 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBP1P32455 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GBP1P32455 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBP1P32455 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBP1P32455 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBP1P32455 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBP1P32455 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBP1P32455 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBP1P32455 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBP1P32455 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBP1P32455 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBP1P32455 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GBP1P32455 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBP1P32455 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBP1P32455 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GBP1P32455 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBP1P32455 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBP1P32455 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBP1P32455 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBP1P32455 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBP1P32455 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBP1P32455 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBP1P32455 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBP1P32455 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBP1P32455 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBP1P32455 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBP1P32455 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBP1P32455 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBP1P32455 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBP1P32455 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBP1P32455 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBP1P32455 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBP1P32455 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBP1P32455 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBP1P32455 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBP1P32455 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBP1P32455 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBP1P32455 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBP1P32455 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms