Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR1P24390 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms