Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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PTPRBP23467 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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PTPRBP23467 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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PTPRBP23467 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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PTPRBP23467 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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