Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF4P18085 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF4P18085 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF4P18085 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF4P18085 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF4P18085 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF4P18085 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF4P18085 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF4P18085 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF4P18085 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF4P18085 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF4P18085 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF4P18085 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF4P18085 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF4P18085 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF4P18085 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF4P18085 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF4P18085 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF4P18085 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF4P18085 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF4P18085 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF4P18085 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF4P18085 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF4P18085 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF4P18085 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF4P18085 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF4P18085 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF4P18085 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF4P18085 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF4P18085 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF4P18085 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF4P18085 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF4P18085 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF4P18085 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF4P18085 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF4P18085 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF4P18085 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF4P18085 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF4P18085 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF4P18085 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF4P18085 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF4P18085 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF4P18085 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF4P18085 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF4P18085 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF4P18085 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF4P18085 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF4P18085 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF4P18085 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF4P18085 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF4P18085 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF4P18085 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF4P18085 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF4P18085 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF4P18085 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF4P18085 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF4P18085 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF4P18085 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF4P18085 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF4P18085 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF4P18085 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF4P18085 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF4P18085 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF4P18085 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF4P18085 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF4P18085 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF4P18085 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF4P18085 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF4P18085 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF4P18085 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF4P18085 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF4P18085 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF4P18085 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF4P18085 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF4P18085 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF4P18085 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF4P18085 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF4P18085 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF4P18085 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF4P18085 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF4P18085 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF4P18085 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF4P18085 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF4P18085 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF4P18085 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF4P18085 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF4P18085 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF4P18085 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF4P18085 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF4P18085 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF4P18085 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF4P18085 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF4P18085 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF4P18085 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF4P18085 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF4P18085 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF4P18085 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF4P18085 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF4P18085 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARF4P18085 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms