Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPD1P17405 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms