Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA1P17302 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA1P17302 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA1P17302 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA1P17302 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA1P17302 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA1P17302 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA1P17302 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA1P17302 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA1P17302 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA1P17302 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA1P17302 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA1P17302 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA1P17302 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA1P17302 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJA1P17302 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA1P17302 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA1P17302 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA1P17302 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA1P17302 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA1P17302 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA1P17302 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA1P17302 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA1P17302 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA1P17302 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA1P17302 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA1P17302 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA1P17302 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA1P17302 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA1P17302 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA1P17302 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA1P17302 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA1P17302 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA1P17302 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA1P17302 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA1P17302 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA1P17302 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA1P17302 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA1P17302 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA1P17302 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA1P17302 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA1P17302 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA1P17302 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA1P17302 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA1P17302 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA1P17302 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA1P17302 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA1P17302 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA1P17302 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA1P17302 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA1P17302 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA1P17302 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA1P17302 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA1P17302 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA1P17302 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA1P17302 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJA1P17302 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJA1P17302 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms