Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
GNB3P16520 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GNB3P16520 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GNB3P16520 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GNB3P16520 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GNB3P16520 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GNB3P16520 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GNB3P16520 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GNB3P16520 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GNB3P16520 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GNB3P16520 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GNB3P16520 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GNB3P16520 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
GNB3P16520 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
GNB3P16520 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
GNB3P16520 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
GNB3P16520 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GNB3P16520 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB3P16520 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB3P16520 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB3P16520 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB3P16520 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB3P16520 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB3P16520 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB3P16520 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB3P16520 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB3P16520 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB3P16520 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB3P16520 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB3P16520 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB3P16520 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB3P16520 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB3P16520 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB3P16520 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB3P16520 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB3P16520 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB3P16520 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB3P16520 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB3P16520 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB3P16520 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB3P16520 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB3P16520 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB3P16520 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB3P16520 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB3P16520 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB3P16520 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB3P16520 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB3P16520 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB3P16520 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB3P16520 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GNB3P16520 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms