Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms