Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms