Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RARBP10826 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RARBP10826 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RARBP10826 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RARBP10826 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RARBP10826 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RARBP10826 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RARBP10826 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RARBP10826 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RARBP10826 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RARBP10826 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RARBP10826 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RARBP10826 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RARBP10826 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RARBP10826 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RARBP10826 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RARBP10826 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RARBP10826 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RARBP10826 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RARBP10826 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RARBP10826 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RARBP10826 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RARBP10826 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RARBP10826 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RARBP10826 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RARBP10826 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RARBP10826 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RARBP10826 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RARBP10826 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RARBP10826 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RARBP10826 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RARBP10826 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RARBP10826 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RARBP10826 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RARBP10826 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RARBP10826 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RARBP10826 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RARBP10826 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RARBP10826 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RARBP10826 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RARBP10826 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms