Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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PKHD1P08F94 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
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PKHD1P08F94 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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PKHD1P08F94 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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PKHD1P08F94 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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PKHD1P08F94 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
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PKHD1P08F94 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PKHD1P08F94 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
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