Protein–RNA interactions for Protein: P08397

HMBS, Porphobilinogen deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBSP08397 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMBSP08397 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMBSP08397 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMBSP08397 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBSP08397 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBSP08397 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBSP08397 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBSP08397 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBSP08397 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBSP08397 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBSP08397 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBSP08397 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBSP08397 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBSP08397 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBSP08397 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBSP08397 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBSP08397 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBSP08397 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBSP08397 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBSP08397 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBSP08397 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBSP08397 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBSP08397 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBSP08397 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBSP08397 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBSP08397 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBSP08397 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBSP08397 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBSP08397 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBSP08397 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBSP08397 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBSP08397 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBSP08397 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBSP08397 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBSP08397 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBSP08397 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBSP08397 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBSP08397 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBSP08397 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBSP08397 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBSP08397 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMBSP08397 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMBSP08397 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMBSP08397 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMBSP08397 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMBSP08397 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMBSP08397 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMBSP08397 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMBSP08397 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBSP08397 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBSP08397 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBSP08397 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBSP08397 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms