Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA4P06727 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA4P06727 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA4P06727 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA4P06727 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA4P06727 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA4P06727 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA4P06727 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA4P06727 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA4P06727 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA4P06727 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA4P06727 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA4P06727 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA4P06727 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA4P06727 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA4P06727 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA4P06727 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA4P06727 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA4P06727 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA4P06727 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA4P06727 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA4P06727 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA4P06727 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA4P06727 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA4P06727 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA4P06727 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA4P06727 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA4P06727 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOA4P06727 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOA4P06727 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOA4P06727 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOA4P06727 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
APOA4P06727 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOA4P06727 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOA4P06727 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOA4P06727 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOA4P06727 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOA4P06727 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOA4P06727 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOA4P06727 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOA4P06727 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOA4P06727 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOA4P06727 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOA4P06727 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOA4P06727 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APOA4P06727 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOA4P06727 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOA4P06727 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOA4P06727 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOA4P06727 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOA4P06727 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOA4P06727 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APOA4P06727 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APOA4P06727 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOA4P06727 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOA4P06727 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APOA4P06727 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APOA4P06727 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APOA4P06727 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOA4P06727 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOA4P06727 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APOA4P06727 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOA4P06727 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOA4P06727 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOA4P06727 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOA4P06727 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOA4P06727 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOA4P06727 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APOA4P06727 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APOA4P06727 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOA4P06727 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOA4P06727 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOA4P06727 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOA4P06727 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APOA4P06727 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOA4P06727 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
APOA4P06727 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOA4P06727 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOA4P06727 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOA4P06727 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOA4P06727 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOA4P06727 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOA4P06727 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOA4P06727 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOA4P06727 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOA4P06727 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APOA4P06727 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOA4P06727 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
APOA4P06727 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOA4P06727 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOA4P06727 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOA4P06727 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOA4P06727 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOA4P06727 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOA4P06727 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOA4P06727 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOA4P06727 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOA4P06727 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOA4P06727 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APOA4P06727 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms