Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNB1P01574 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms