Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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CLDN9O95484 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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CLDN9O95484 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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CLDN9O95484 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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CLDN9O95484 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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CLDN9O95484 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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CLDN9O95484 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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CLDN9O95484 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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