Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPAG9O60271 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPAG9O60271 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPAG9O60271 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPAG9O60271 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPAG9O60271 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SPAG9O60271 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SPAG9O60271 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPAG9O60271 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SPAG9O60271 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms