Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCF2LO15068 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms