Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 DUSP10-201ENST00000366899 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLGNO14967 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLGNO14967 PNPO-217ENST00000642017 3465 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLGNO14967 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLGNO14967 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLGNO14967 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLGNO14967 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLGNO14967 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLGNO14967 SPOCK3-203ENST00000421836 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLGNO14967 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLGNO14967 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLGNO14967 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLGNO14967 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLGNO14967 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLGNO14967 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLGNO14967 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLGNO14967 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLGNO14967 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLGNO14967 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLGNO14967 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLGNO14967 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLGNO14967 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLGNO14967 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLGNO14967 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLGNO14967 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLGNO14967 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLGNO14967 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLGNO14967 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLGNO14967 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLGNO14967 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLGNO14967 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLGNO14967 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLGNO14967 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLGNO14967 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLGNO14967 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLGNO14967 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLGNO14967 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLGNO14967 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLGNO14967 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLGNO14967 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLGNO14967 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLGNO14967 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLGNO14967 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLGNO14967 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLGNO14967 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLGNO14967 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLGNO14967 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms