Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CUX2O14529 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CUX2O14529 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CUX2O14529 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CUX2O14529 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CUX2O14529 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CUX2O14529 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CUX2O14529 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CUX2O14529 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CUX2O14529 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CUX2O14529 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CUX2O14529 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CUX2O14529 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CUX2O14529 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CUX2O14529 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUX2O14529 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUX2O14529 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUX2O14529 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUX2O14529 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUX2O14529 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUX2O14529 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUX2O14529 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUX2O14529 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUX2O14529 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUX2O14529 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUX2O14529 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUX2O14529 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUX2O14529 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUX2O14529 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUX2O14529 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CUX2O14529 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUX2O14529 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CUX2O14529 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUX2O14529 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CUX2O14529 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CUX2O14529 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUX2O14529 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUX2O14529 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUX2O14529 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUX2O14529 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUX2O14529 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUX2O14529 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CUX2O14529 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUX2O14529 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUX2O14529 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUX2O14529 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUX2O14529 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CUX2O14529 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CUX2O14529 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUX2O14529 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUX2O14529 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUX2O14529 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CUX2O14529 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUX2O14529 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CUX2O14529 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUX2O14529 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUX2O14529 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUX2O14529 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUX2O14529 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUX2O14529 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUX2O14529 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUX2O14529 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUX2O14529 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUX2O14529 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUX2O14529 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUX2O14529 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUX2O14529 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUX2O14529 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUX2O14529 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUX2O14529 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUX2O14529 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUX2O14529 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUX2O14529 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUX2O14529 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUX2O14529 PLA2G2A-201ENST00000375111 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUX2O14529 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUX2O14529 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CUX2O14529 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUX2O14529 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUX2O14529 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUX2O14529 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUX2O14529 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CUX2O14529 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUX2O14529 LINC02352-201ENST00000557928 468 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUX2O14529 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUX2O14529 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUX2O14529 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUX2O14529 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUX2O14529 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUX2O14529 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUX2O14529 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUX2O14529 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUX2O14529 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUX2O14529 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUX2O14529 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUX2O14529 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUX2O14529 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUX2O14529 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUX2O14529 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUX2O14529 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms