Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EBAG9O00559 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
EBAG9O00559 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EBAG9O00559 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EBAG9O00559 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EBAG9O00559 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBAG9O00559 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBAG9O00559 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBAG9O00559 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EBAG9O00559 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBAG9O00559 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBAG9O00559 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EBAG9O00559 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
EBAG9O00559 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBAG9O00559 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBAG9O00559 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBAG9O00559 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EBAG9O00559 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EBAG9O00559 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EBAG9O00559 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EBAG9O00559 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBAG9O00559 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EBAG9O00559 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EBAG9O00559 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EBAG9O00559 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EBAG9O00559 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBAG9O00559 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EBAG9O00559 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EBAG9O00559 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EBAG9O00559 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EBAG9O00559 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EBAG9O00559 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBAG9O00559 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBAG9O00559 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EBAG9O00559 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBAG9O00559 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBAG9O00559 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBAG9O00559 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBAG9O00559 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EBAG9O00559 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EBAG9O00559 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EBAG9O00559 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBAG9O00559 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EBAG9O00559 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EBAG9O00559 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EBAG9O00559 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBAG9O00559 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EBAG9O00559 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EBAG9O00559 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EBAG9O00559 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EBAG9O00559 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EBAG9O00559 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EBAG9O00559 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EBAG9O00559 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EBAG9O00559 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EBAG9O00559 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
EBAG9O00559 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EBAG9O00559 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
EBAG9O00559 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EBAG9O00559 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EBAG9O00559 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EBAG9O00559 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EBAG9O00559 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EBAG9O00559 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EBAG9O00559 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
EBAG9O00559 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EBAG9O00559 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EBAG9O00559 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EBAG9O00559 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EBAG9O00559 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EBAG9O00559 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
EBAG9O00559 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
EBAG9O00559 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EBAG9O00559 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
EBAG9O00559 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EBAG9O00559 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EBAG9O00559 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms