Protein–RNA interactions for Protein: O00421

CCRL2, C-C chemokine receptor-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCRL2O00421 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CCRL2O00421 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCRL2O00421 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCRL2O00421 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCRL2O00421 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCRL2O00421 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCRL2O00421 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCRL2O00421 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCRL2O00421 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCRL2O00421 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCRL2O00421 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCRL2O00421 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCRL2O00421 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCRL2O00421 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CCRL2O00421 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CCRL2O00421 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCRL2O00421 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCRL2O00421 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCRL2O00421 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCRL2O00421 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCRL2O00421 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCRL2O00421 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCRL2O00421 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCRL2O00421 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCRL2O00421 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCRL2O00421 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CCRL2O00421 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CCRL2O00421 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCRL2O00421 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CCRL2O00421 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCRL2O00421 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCRL2O00421 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCRL2O00421 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCRL2O00421 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CCRL2O00421 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCRL2O00421 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCRL2O00421 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCRL2O00421 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCRL2O00421 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCRL2O00421 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCRL2O00421 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCRL2O00421 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCRL2O00421 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCRL2O00421 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCRL2O00421 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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