Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QRK9 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QRK9 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QRK9 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QRK9 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QRK9 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QRK9 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QRK9 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QRK9 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QRK9 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QRK9 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms