Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

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Length 135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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LINC01387J3KSC0 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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LINC01387J3KSC0 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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LINC01387J3KSC0 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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LINC01387J3KSC0 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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LINC01387J3KSC0 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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LINC01387J3KSC0 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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LINC01387J3KSC0 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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LINC01387J3KSC0 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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LINC01387J3KSC0 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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LINC01387J3KSC0 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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