Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms