Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEMP2A6NFY4 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms