Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TARSL2A2RTX5 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms