Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms