Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

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Length 1,435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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