Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2H6

FNDC3A, Fibronectin type-III domain-containing protein 3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC3AQ9Y2H6 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC3AQ9Y2H6 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms