Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SNX6Q9UNH7 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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