Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MBD1Q9UIS9 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms