Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCHIP1Q9P0W5 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCHIP1Q9P0W5 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCHIP1Q9P0W5 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCHIP1Q9P0W5 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCHIP1Q9P0W5 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCHIP1Q9P0W5 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCHIP1Q9P0W5 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCHIP1Q9P0W5 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCHIP1Q9P0W5 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCHIP1Q9P0W5 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SCHIP1Q9P0W5 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCHIP1Q9P0W5 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCHIP1Q9P0W5 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCHIP1Q9P0W5 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCHIP1Q9P0W5 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCHIP1Q9P0W5 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCHIP1Q9P0W5 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCHIP1Q9P0W5 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCHIP1Q9P0W5 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCHIP1Q9P0W5 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms