Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20BQ9P0W2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20BQ9P0W2 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms